Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms