Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PxnQ8VI36 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PxnQ8VI36 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms