Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma3Q8JZW8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms