Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrrc9Q8CDN9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc9Q8CDN9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms