Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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