Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvoplQ6PDF3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvoplQ6PDF3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms