Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprdQ64487 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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PtprdQ64487 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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PtprdQ64487 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PtprdQ64487 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PtprdQ64487 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PtprdQ64487 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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