Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms