Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cntnap5cQ0V8T7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5cQ0V8T7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5cQ0V8T7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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