Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms