Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms