Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms