Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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