Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Paxbp1P58501 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms