Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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CtdsplP58465 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CtdsplP58465 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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