Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CartptP56388 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms