Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Psen1P49769 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Psen1P49769 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Psen1P49769 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Psen1P49769 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Psen1P49769 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psen1P49769 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms