Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf4P43488 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tnfsf4P43488 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf4P43488 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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