Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms