Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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