Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms