Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms