Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm379J3QQ19 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms