Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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