Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd35E9Q9D8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd35E9Q9D8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms