Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms