Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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