Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11cB4XVP9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms