Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms