Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Rabgef1Q9JM13 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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