Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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