Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms