Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms