Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1bQ9D0N7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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