Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RpainQ9CWY9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RpainQ9CWY9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RpainQ9CWY9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RpainQ9CWY9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RpainQ9CWY9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RpainQ9CWY9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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