Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms