Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms