Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlgn1Q99K10 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms