Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SdsQ8VBT2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms