Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma3Q8JZW8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms