Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim61Q8JZK6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim61Q8JZK6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim61Q8JZK6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim61Q8JZK6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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