Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc28aQ8CEI3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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