Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C5C9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms