Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms