Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms