Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Med16Q6PGF3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms