Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zmat1Q3V0C1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms