Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cpne9Q1RLL3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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