Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms