Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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